It-teknoloġija tal-elettroforeżi bil-ġell bidimensjonali u t-teknoloġija tal-ispettrometrija tal-massa bħalissa huma l-metodi l-aktar użati għall-istudju tal-proteomika. It-teknoloġija tal-elettroforeżi bil-ġell bidimensjonali tuża l-punt isoelettriku tal-proteina u d-differenza fil-piż molekulari biex tiddistingwi diversi proteini. Għalkemm huwa diffiċli li wieħed jiddistingwi l-proteini b'abbundanza baxxa permezz ta 'elettroforeżi tal-ġell bidimensjonali, għandu rekwiżiti ogħla għall-operazzjoni, iżda l-ammont għoli ta' produzzjoni, riżoluzzjoni tajba u riproduċibbiltà tiegħu, u l-karatteristiċi tiegħu li jiġi kkombinat ma 'spettrometrija tal-massa jagħmilha l-metodi ta' riċerka Proteomics l-aktar popolari u affidabbli. It-teknoloġija tal-elettroforeżi bil-ġell bidimensjonali u l-proċeduri ta' riċerka tal-proteomika bbażata fuq l-ispettrometrija tal-massa huma t-tbajja' tal-ġell tal→isoelettrika tal-kampjun→omforeżi tal-ġell tal-polilikrilammid→tebbis tal-ġell → li tiddifferixxi spots ta 'proteini ta' diġestjoni ta 'interess fil→ġell→astrometrija tal-majka biex tiddetermina l-peptidi Marki tas-swaba' jew bażi tad→data ta 'użu parzjali ta' aċidu amminiku biex tiddetermina l-proteina. Ir-riċerka dwar il-proteomika teħtieġ separazzjoni tal-proteini b'riżoluzzjoni għolja u tekniki ta'identifikazzjoni preċiżi u sensittivi tal-ispettrometrija tal-massa. Il-kulur tal-proteini fl-elettroforeżi tal-ġell mhux biss jaffettwa r-riżoluzzjoni tas-separazzjoni tal-proteini, iżda jaffettwa wkoll l-identifikazzjoni sussegwenti tal-ispettrometru tal-massa. It-tbajja' tal-proteini jistgħu jinqasmu f'erba' kategoriji: tbajja' organiċi tar-reaġent, tbajja' tal-fidda, tbajja fluworexxenti u kolorazzjoni tal-iżotopi.
Unlu et al. ippropona metodu ta' analiżi proteomika kwantitattiva ta' elettroforomika kwantitattiva għad-differenzjali tal-fluworexxenza (F-2D-DIGE). L-elettroforeżi differenzjali tal-ġell (DIGE) hija titjib tekniku ta' 2-DE. Dan jgħaqqad il-metodu ta' analiżi multipla tal-fluworexxenza. Hija tissepara kampjuni multipli ttikkettati bi fluworexxenza differenti fuq l-istess ġell u tintroduċi l-kunċett intern Il-kunċett sottostanti. Il-proteini fiż-żewġ kampjuni jitħalltu ma' tikketti fluworexxenti differenti biex iwettqu 2-DE biex jiskopru l-espressjoni tal-proteina fiż-żewġ kampjuni, li ttejjeb ħafna l-eżattezza, l-affidabbiltà u r-ripetibbiltà tar-riżultati. Fit-teknoloġija DIGE, kull post ta 'proteina għandu l-istandard intern tiegħu stess, u s-softwer jista' awtomatikament jikkalibra l-espressjoni tiegħu skond l-istandard intern ta 'kull post ta' proteina biex jiżgura li l-bidliet ta 'abbundanza ta' proteini misjuba huma veri. Teknoloġija DIGE ġiet applikata f'diversi kampjuni.